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全球首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組發(fā)布

時(shí)間:2024-05-29 18:19:56|來源:大河網(wǎng)|點(diǎn)擊量:3392

科技日?qǐng)?bào)訊(記者 雍黎)5月27日,記者從重慶市農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,該院果樹研究所柑橘創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)楊蕾、洪林、王敏、李霜等研究人員發(fā)布了國際首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組。相關(guān)研究成果近日在國際期刊《科學(xué)數(shù)據(jù)》發(fā)表。

楊蕾介紹,血橙是一種極具特色的甜橙品種,具有較高花青素含量,其含有的多種成分對(duì)人體健康有益。目前,國內(nèi)血橙主要在川渝地區(qū)種植,總種植面積超過100萬畝,其中重慶有40余萬畝。然而,現(xiàn)主栽血橙品種存在品質(zhì)不穩(wěn)定等問題。

團(tuán)隊(duì)開展自主品種選育,發(fā)掘高糖高花青素的芽變新資源“內(nèi)秀”。其花青素含量更高,血色更深,糖度也更高。由于國際上尚未有公開發(fā)布的高質(zhì)量血橙基因組,團(tuán)隊(duì)利用第三代測(cè)序技術(shù),對(duì)血橙芽變資源進(jìn)行了全基因組測(cè)序,成功組裝了首個(gè)血橙高質(zhì)量基因組,測(cè)序深度可達(dá)65X,基因組組裝完整度評(píng)估為98.20%。此外,團(tuán)隊(duì)結(jié)合比較基因組學(xué)分析,揭示了血橙花青素合成能力的染色體結(jié)構(gòu)變異基礎(chǔ)。

檢測(cè)分析表明,在中國西南地區(qū),“內(nèi)秀”在甜度和紅度方面都超過了當(dāng)?shù)刂髁髌贩N“塔羅科”血橙,具有強(qiáng)大市場(chǎng)潛力。此項(xiàng)成果將有力推動(dòng)高品質(zhì)血橙功能基因研究和基因組進(jìn)化研究工作,并為后續(xù)血橙特異基因挖掘和育種利用提供核心素材。

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